连锁分析应用的微卫星标记信息量有限,所定位区域往往较大,很难从其中找出真正的易感基因;而功能候选基因研究假设则完全是基于对疾病发病机制的推测基础之上,具有很大的盲目性。定位候选克隆则是在确定的疾病易感区域内进行的功能候选基因研究,该方法结合了定位克隆和功能候选基因研究的优点。因此具有更高的效能。从SLEV1区域中选取177个SN。
在144个同时患有白癜风和自身免疫病家系中进行了精细定位,将1713区域缩小至NAL1基因及其启动子区域。随后对11个患者NAL1基因及其启动子区域进行DNA测序,确定该区域的SNs,并对该区域的SN。在上述114个家系中进行验证,较终发现2个SN与自身免疫性疾病以及白癜风的易感性相关。
随后,该课题组等又在高加索患者和罗马尼亚对照中分关联研究中,进一步证实了该结果。从AIS1区域内选择8个候选基因,并对其启动区域和编码区域进行测序,共发现25个序列变异。其中2个序列变异在家系中与白癜风共分离。
将变异序列和野生序列共转染到畸胎癌(该基因表达)和黑素细胞(该基因不表达)中发现在畸胎癌中表达显著增强,民间偏方治疗白癜风而黑素细胞里表达无明显改变。说明该突变是通过影响黑素细胞前体神经管嵴成黑素细胞来抑制该系谱的分化。